期刊简介

               本刊(中国自然科学核心期刊)系军事医学科学院主办的国内外公开发行的综合性学术期刊。本刊以刊登军事医学及相关学科的创新性论著为主,选登部分研究简报,技术方法及有一定指导性的文献综述。内容涉及放射医学、微生物学与流行病学、药理学与毒理学、药物化学、基础医学、卫生学与环境医学、卫生装备、临床医学及医学高新技术等领域。                

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  • 杂志名称:军事医学杂志
  • 主管单位:军事医学科学院
  • 主办单位:军事医学科学院
  • 国际刊号:1674-9960
  • 国内刊号:11-5950/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中国自然科学核心期刊期刊收录:知网收录(中), 上海图书馆馆藏, CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), CA 化学文摘(美), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊)
军事医学杂志2009年第06期

我国部分地区HIV-1流行毒株亚型分布及gag基因变异特征研究

陈立力;刘永健;李韩平;鲍作义;庄道民;刘思扬;王铮;赖章丽;李林;李敬云

关键词:人类免疫缺陷病毒1型, gag基因, 基因型, 遗传变异
摘要:目的:分析我国4个地区的人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)主要流行毒株的亚型分布,以及在宿主免疫压力下的基因变异和抗原表位的变化情况,初步探讨这些地区HIV-1 gag基因的分子进化特征.方法:从来自河南、广东、四川、北京的HIV-1感染者血浆样本中提取基因组RNA,经逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增部分gag基因,用扩增产物直接进行测序;使用Genotyping Tool软件进行亚型分析,使用MEGA 4.1软件绘制系统进化树;用Distance工具计算各个亚型序列的基因离散率;用SNAP程序分析同义替换率与非同义替换率的比值(Ks/Ka),并对各亚型中我国人群中较常见的HLA-Ⅰ型限制的CTL抗原表位的突变情况进行分析. 结果:这些地区HIV-1 主要流行毒株gag基因亚型主要是B'、CRF07_BC、CRF01_AE、B、CRF08_BC和CRF02_AG.各亚型内的基因离散率不同,由大到小排列为CRF01_AE>B>CRF08_BC>CRF07_BC>B',Ks/Ka为CRF01_AE>B>CRF08_BC> B'>CRF07_BC.p17区段的CTL抗原表位变异远大于p24区段.各个亚型共享序列中存在的突变位点由多到少排列为CRF01_AE>B>B'>CRF07_BC.结论:我国HIV-1流行毒株的gag基因序列中,CRF01_AE亚型受到的选择压力大,基因离散率也大,且CTL抗原表位的变异亦大,其次是B和B'亚型,CRF07_BC亚型变异小.各亚型间CTL抗原表位变异的差异明显.