期刊简介

               本刊(中国自然科学核心期刊)系军事医学科学院主办的国内外公开发行的综合性学术期刊。本刊以刊登军事医学及相关学科的创新性论著为主,选登部分研究简报,技术方法及有一定指导性的文献综述。内容涉及放射医学、微生物学与流行病学、药理学与毒理学、药物化学、基础医学、卫生学与环境医学、卫生装备、临床医学及医学高新技术等领域。                

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  • 杂志名称:军事医学杂志
  • 主管单位:军事医学科学院
  • 主办单位:军事医学科学院
  • 国际刊号:1674-9960
  • 国内刊号:11-5950/R
  • 出版周期:月刊
期刊荣誉:中国自然科学核心期刊期刊收录:知网收录(中), 上海图书馆馆藏, CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), CA 化学文摘(美), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 维普收录(中), 国家图书馆馆藏, 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊)
军事医学杂志2014年第05期

下一代测序数据的质量控制研究

刘圣;冯祖仁;高山

关键词:下一代测序, 高通量测序, 数据处理, 质量控制
摘要:目的:对下一代测序数据质量控制的几个主要问题进行分析,设计数据清理和质量控制软件,为下游的数据分析提供保障。方法基于Bioconducter 软件包,开发了一个数据清理软件( Fastq_clean )。结果该软件在一组已发表的菊花转录组数据集上测试,得到了清理后的测序数据,同时输出了质量控制信息。结论该软件在充分利用Illumina序列特征的基础上,可以非常精确地去除低质量残基、接头、rRNA和病毒等污染,大限度保留了高质量数据。